Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms