Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXC5Q00444 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms