Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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