Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB4BP68371 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms