Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA4AP68366 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA4AP68366 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA4AP68366 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA4AP68366 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA4AP68366 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA4AP68366 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA4AP68366 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA4AP68366 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA4AP68366 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA4AP68366 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA4AP68366 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA4AP68366 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms