Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms