Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms