Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OXCT1P55809 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms