Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP53609 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms