Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms