Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNTAP49354 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms