Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms