Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSFMP43897 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSFMP43897 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms