Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRATP43155 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRATP43155 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRATP43155 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms