Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms