Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TGFBR1P36897 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms