Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms