Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LMO1P25800 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LMO1P25800 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms