Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms