Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MMP11P24347 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MMP11P24347 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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