Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAV1P15498 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAV1P15498 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms