Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms