Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms