Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHGAP10645 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHGAP10645 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms