Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM58BPP0C7Q3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms