Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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