Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms