Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX4O95219 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX4O95219 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX4O95219 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX4O95219 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX4O95219 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX4O95219 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX4O95219 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX4O95219 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX4O95219 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX4O95219 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX4O95219 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX4O95219 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms