Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCATO75600 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCATO75600 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCATO75600 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms