Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms