Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DENRO43583 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DENRO43583 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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