Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBDO15205 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms