Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms