Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms