Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms