Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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USP17L12C9JPN9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP17L12C9JPN9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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