Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DGG1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DGG1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DGG1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B4DGG1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DGG1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DGG1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DGG1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms