Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISM1B1AKI9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms