Protein–RNA interactions for Protein: A6NF01

POM121B, Putative nuclear envelope pore membrane protein POM 121B, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121BA6NF01 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POM121BA6NF01 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms