Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms