Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ARL2-SNX15V9GYD0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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