Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms