Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CCL27Q9Y4X3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CCL27Q9Y4X3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CCL27Q9Y4X3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CCL27Q9Y4X3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CCL27Q9Y4X3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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CCL27Q9Y4X3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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