Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRAPPC4Q9Y296 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRAPPC4Q9Y296 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRAPPC4Q9Y296 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRAPPC4Q9Y296 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRAPPC4Q9Y296 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC4Q9Y296 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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