Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms