Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms