Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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USP18Q9UMW8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP18Q9UMW8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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