Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRPF3Q9ULD4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms