Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT1Q9P2V4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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