Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms